Cryo-EM

RELION (for REgularized LIkelihood OptimizatioN)은 전자 냉동 현미경(Cryo-EM) 분석을 위한 empirical Bayesian 접근법을 구현한다.

특히 2D 클래스 평균뿐만 아니라 단수 또는 복수 3D 재구성의 개선 방법을 제공한다.

RELION은 살아있는 세포 연구에 중요한 도구다.

RELION은 단일 입자 분석 워크플로우 전체를 포괄하는 여러 단계로 구성된다.

단계에는 beam-induced motion-correction, CTF estimation, automated particle picking, particle extraction, 2D class averaging, 3D classification, 3D high-resolution refinement을 포함한다.

RELION은 direct-electron detectors에서 생성된 movie들을 처리하고, final map sharpening을 적용하고, local-resolution 평가를 수행할 수 있다.

CryoSPARC은 single particle cryo-EM 데이터로부터 3D 구조 정보를 얻기 위해 세계적으로 사용되는 최첨단 플랫폼이다.

CryoSPARC 플랫폼은 연구 및 신약 개발을 위한 단백질, 바이러스 및 분자 단위의 자동화된 고품질 고처리 구조 발견을 가능하게 한다.

CryoSPARC은 발전된 고성능 수치 구현을 지원하는 최첨단 알고리즘, 그리고 고처리된 단일 입자 cryo-EM 워크플로우에 작동할 수 있도록 설계된 소프트웨어를 결합한 통합 플랫폼이다.

Raw microscope data를 안전하고 원활하게 처리하기 위하여 최상의 워크플로우와 도구를 제공한다.

• Pre-processing of microscope data, including global and local motion correction, estimation of microscope parameters, curation and culling of individual micrographs
• Particle picking, sorting and classifying 2D images to remove low-quality information
• Ab-initio 3D structure determination of homogeneous and heterogeneous samples, without the need for prior knowledge of the structure or conformations present
• Refinement of 3D structures to near-atomic resolution, with specialized algorithms for membrane proteins and difficult cases
• Post-processing of maps for use in atomic modeling